কোচ আর্থার জিকোর পরিচালনায় 2007-2008 মৌসুমে ফেনারবাচে উয়েফা চ্যাম্পিয়ন্স লিগে সবচেয়ে সফল পারফরম্যান্স অর্জন করে।
উল্লিখিত মৌসুমে গ্রুপ থেকে বিদায় নেওয়ার পর, হলুদ-গাঢ় নীল দলটি স্প্যানিশ দল সেভিলাকে পেনাল্টি শুটআউটে হারিয়ে কোয়ার্টার ফাইনালে পৌঁছে এবং এই রাউন্ডে ইংলিশ দল চেলসির মুখোমুখি হয়। Fenerbahçe প্রতিপক্ষকে 2-1 গোলে পরাজিত করে এবং রাস্তায় 2-0 গোলে হেরে সংগঠনকে বিদায় জানায়।
ফেনারবাহচে ঘরের মাঠে আর্সেনালের কাছে ৫-২ ব্যবধানে হেরেছিল, যার সাথে এটি ২০০৮-২০০৯ মৌসুমে উয়েফা চ্যাম্পিয়ন্স লিগে জুটিবদ্ধ হয়েছিল এবং ০-০ গোলে ড্র করেছিল।
ফেনারবাহচে, যেটি 2013-2014 মৌসুমে উয়েফা চ্যাম্পিয়ন্স লিগের প্লে-অফ ম্যাচে আবারও আর্সেনালের মুখোমুখি হয়েছিল, ঘরের মাঠে প্রথম ম্যাচে 3-0 এবং দ্বিতীয় ম্যাচে 2-0 গোলে হেরেছিল।
হলুদ-গাঢ় নীল দলটি অ্যাস্টন ভিলার কাছে 6-0 গোলে হেরেছে, যেটি তারা এই মৌসুমে লীগ পর্বে শেষবার মুখোমুখি হয়েছিল।